はい、一般的なACMEクライアントでは、

・秘密鍵の生成
・CSR（証明書署名要求）の作成
・証明書の取得
・サーバーへのインストール

まで対応可能です。

具体的な対応範囲や設定方法は、ご利用のACMEクライアントの仕様をご確認ください。