単一名(ワイルドカードではない)証明書では、通常、申込んだホスト名に加えてwww有無のもう一方(www.example.com ⇄ example.com)も自動的にSANへ追加され、両方でご利用いただけます。
ただし、追加される側もドメイン使用権確認(DCV/ファイル・DNS認証)が取れることが条件です。片方でしか認証が取れなかった場合は、認証できた方のホスト名のみが証明書の対象になります(例:www無しのURLで認証確認が取れないと、www付きのみで発行されます)。
両方でご利用になる場合は、再発行時に www有り・www無しの両方で認証が取れる状態(認証ファイルの設置、またはDNSレコードの登録)にしてから発行してください。